在南京地区，有多家公司提供三维医学动画制作服务，但要说哪家好，这通常取决于多个因素，包括公司的制作经验、技术实力、客户反馈以及作品质量等。以下是一些在南京地区较为知名的、提供三维医学动画制作服务的公司推荐：

　　1、南京互邦文化传媒有限公司：

　　业务范围：该公司拥有20年的影视制作经验，三维动画制作是其核心业务之一，涵盖了多个领域，包括医学在内。

　　医学相关案例：虽然未直接提及具体的医学三维动画案例，但考虑到其丰富的动画制作经验和广泛的业务领域，该公司很可能具备制作医学三维动画的能力。

　　2、南京聚光源广告：

　　技术实力：公司运用先进的运动捕捉技术，为数字影视、数字动画等提供高质量、高效率、低成本的3D数字内容制作。

　　医学领域应用：虽然公司未直接提及医学三维动画，但其技术和系统可以广泛应用于包括医学在内的多个领域，因此具备制作医学三维动画的潜力。

　　需要注意的是，由于不同公司的制作风格、技术实力和价格策略等存在差异，因此在选择时需要根据自己的实际需求和预算进行综合考虑。同时，建议查看公司的作品集或案例，以了解其制作水平和风格是否符合自己的要求。